Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms