Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms