Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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