Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zscan5bB2RTN3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms