Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms