Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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1700011M02RikB1AX35 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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1700011M02RikB1AX35 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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1700011M02RikB1AX35 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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1700011M02RikB1AX35 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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1700011M02RikB1AX35 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700011M02RikB1AX35 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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1700011M02RikB1AX35 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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