Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700042G07RikB1AUF7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700042G07RikB1AUF7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
1700042G07RikB1AUF7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700042G07RikB1AUF7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms