Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700084M14RikB1AT01 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700084M14RikB1AT01 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms