Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms