Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm6880A3KG45 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm6880A3KG45 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm6880A3KG45 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm6880A3KG45 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm6880A3KG45 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6880A3KG45 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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