Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms