Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Upf2A2AT37 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf2A2AT37 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms