Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga8A2ARA8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga8A2ARA8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms