Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Frmpd1A2AKB4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms