Protein–RNA interactions for Protein: A2AEP0

Obp1b, Odorant-binding protein 1b, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obp1bA2AEP0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obp1bA2AEP0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obp1bA2AEP0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms