Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb4A2A863 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb4A2A863 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms