Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms