Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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