Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trbv30A0A0B4J1P1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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