Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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