Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B661

Trdv5, T cell receptor delta variable 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv5A0A075B661 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trdv5A0A075B661 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trdv5A0A075B661 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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