Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I0

Ighv1-13, Immunoglobulin heavy variable V1-13, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-13A0A075B5I0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-13A0A075B5I0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-13A0A075B5I0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-13A0A075B5I0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms