Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Rabgef1Q9JM13 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rabgef1Q9JM13 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rabgef1Q9JM13 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rabgef1Q9JM13 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rabgef1Q9JM13 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rabgef1Q9JM13 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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