Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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