Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms