Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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