Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms