Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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