Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Trim39Q9ESN2 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Trim39Q9ESN2 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Trim39Q9ESN2 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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