Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms