Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Nsmce3Q9CPR8 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms