Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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Rbbp4Q60972 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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Rbbp4Q60972 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rbbp4Q60972 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194 ms