Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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