Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms