Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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