Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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Hoxd9P28357 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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