Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P10404 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
P10404 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms