Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clrn2B2RVW2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms