Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Hdac5Q9Z2V6 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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