Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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