Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms