Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pkp1P97350 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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