Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpraP18052 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms