Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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