Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Opn1mwO35599 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Opn1mwO35599 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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