Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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Cldn22Q9D7U6 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Cldn22Q9D7U6 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn22Q9D7U6 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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