Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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