Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PcolceQ61398 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms