Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms