Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Cldn18P56857 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms